Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASSF1Q9NS23 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms