Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBQLN4Q9NRR5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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