Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLMPQ9H6B4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms