Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4AQ9BY43 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4AQ9BY43 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms