Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARD11Q9BXL7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARD11Q9BXL7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms