Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRIP1Q9BX63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms