Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms