Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD2Q9BTF0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms