Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM83CQ9BQN1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms