Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3CQ99985 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms