Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms