Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms