Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms