Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms