Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC41A2Q96JW4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms