Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC97Q96F63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms