Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms