Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC1Q96C34 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms