Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRF4Q8WWF5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms