Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA4Q8WW22 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms