Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms