Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms