Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms