Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms