Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms