Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME9Q86XW9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms