Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms