Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLRP9Q7RTR0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP9Q7RTR0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms