Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNDC1Q76NI1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KNDC1Q76NI1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms