Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms