Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms