Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms