Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms