Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL35Q6PF15 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms