Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6P435 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6P435 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6P435 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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