Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms