Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms