Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNS3Q68CZ2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms