Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1DP3Q658K8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms