Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD276Q5ZPR3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms