Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms