Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms