Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q5VSD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q5VSD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q5VSD8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms