Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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