Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDCCQ504Y2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms