Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q499Y3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q499Y3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q499Y3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q499Y3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms