Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HFEQ30201 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms