Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms