Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms