Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKPD1Q17RQ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKPD1Q17RQ9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKPD1Q17RQ9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKPD1Q17RQ9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKPD1Q17RQ9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms